沼气发电站的运行管理应该注意以下事项。
机组使用前检查防护罩等安全装置，应齐全完好。天然气供应管道及连接部位硬密封可靠，不准有泄漏或渗漏。发电机及控制屏所用电缆、电线的绝缘性能应可靠，并按产品说明书规定定期检测及时更换不合格的电缆。沼气供应管线(特别是弯管处)、控制阀的壁厚定期检测并及时更换壁厚差的管阀。启动前人工盘车检査，机组应转动灵活，无卡阻现象。电站内不准放置易燃、易爆物品。机组所配置的运行安全装置：油压低自动停机装置、超速停机装置、燃气防爆装置、电压电流超载保护器等安全保护装置应保持良好的性能状态。
高压送电后，启动机组空车运行，检查相序，经确认合格后并网发电运行。在机组运行期间，不得拆卸或擦拭运动部分的任何部件，要加强巡回检查，注意各个部件的运转情况，发现异常应立即停车检查，并及时汇报和组织排除，在确认故障排除后，方可开车。在机组运行期间，值班人员必须按时巡视机组的运转状况，定期检查填写机组的各种技术参数(水温、油温、排温、机油压力、电流功率、频率等)。
在机组停机期间，定期检查水路、气路有无泄漏情况，并及时汇报检修状况。机房内工作使用的电器、照明设施应防爆，公用普通工具应注意不准碰击产生火星。每天对机组非运转部件彻底擦洗一遍，保证机组外观的清洁，无油污、灰尘，确保机组露原色。
